生信爱好者周刊（第 123 期）：Hello GPT-4o¶

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本周话题：Hello GPT-4o ¶

5 月 14 日凌晨 OpenAI 举办了首次「春季新品发布会」。此次发布会最大的亮点就是新旗舰模型 GPT-4o 的推出，其中「o」是 “omni（全能）”的意思。GPT-4o 可以接受文本、音频和图像的任意组合作为输入，并生成文本、音频和图像的任意组合输出，且这些内容的反馈都是实时的，因此使用 GPT-4o 就像和真人进行互动那样轻松自然。

比如实时语音交互，之前 ChatGPT 的进行语音对话会有几秒的延迟，中间的等待时间总让人觉得不自然。而 GPT-4o 能在 232 毫秒内响应音频输入，平均响应时间为 320 毫秒，与人类在对话中的响应时间相近。并且即使是面对回答被突然中断、多人同时谈话等复杂的情况，GPT-4o 也能完美理解。

@shixiangwang：感觉 AI 迭代的节奏相当快，还没回过神，新的技术已经不再新。

生信研究¶

1、Science | 肿瘤浸润 B 细胞图谱

本研究全面分析了20种癌症类型中的B细胞。研究发现，肿瘤浸润B细胞的响应分为生发中心（GC）样和滤泡外（EF）两类。GC样响应的Bm cells与有效的抗肿瘤免疫和良好的预后相关，而EF响应的AtM B cells 则与免疫抑制和较差的预后相关。

论文链接：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38696569/

2、NAR | 世界上首个基于荧光图像数据的单细胞多组学数据库——iSMOD

本研究报道了世界上首个基于荧光图像数据的单细胞多组学数据库iSMOD。随着多组学数据的激增，整合现有数据以供后续研究使用变得关键。iSMOD数据库集成了多个公共数据库的基因、物种、蛋白、细胞类型及探针信息，收录了23,288篇相关文献的荧光原位杂交(FISH)图像数据,包括空间基因组、转录组和蛋白质组数据。iSMOD的建立有助于整合和利用日益增长的成像多组学数据,促进相关研究的发展。

论文链接：https://academic.oup.com/nar/article/51/16/8348/7223586?login=false

3、Nature Communications | 甲基化检测新算法可利用HiFi测序准确检测基因组单倍型5mC

DNA甲基化作为表观遗传的一种重要形式，在染色质结构和组织水平上的生物过程中起主要作用。近年来三代测序技术（牛津纳米孔测序和PacBio单分子实时测序）的迅速发展为DNA甲基化，尤其是为DNA 5mC的检测带来了新的机遇。本研究研究基于PacBio HiFi测序技术，提出了可准确检测全基因组单倍型5mC的方法和流程，并开发了相应的软件ccsmeth和ccsmethphase。